求数据的前n个主成分
求出第一个主成分以后,如何求出下一个主成分呢?
- 将数据进行改变,将数据在第一个主成分上的分量去掉。
$X^{'(i)}$ 是X中去除第一个主成分上的分量之后剩下的结果。 求下一个主成分 - 将第一个主成分上的分量去掉,在新的数据上求第一个主成分
def first_n_components(n, X, eta = 0.001, n_iters=1e4, epsilon=1e-8):
def first_component(X, initial_w, eta=0.001, n_iters=1e4, epsilon=1e-8):
def f(X, w):
return np.sum(X.dot(w) ** 2) / len(X)
def df(X, w):
return X.T.dot(X.dot(w)) * 2 / len(X)
def direction(w): # 求单位向量
return w / np.linalg.norm(w)
w = direction(initial_w)
i_iter = 0
while (i_iter < n_iters):
last_w = w
gradient = df(X, w)
w = w + eta * gradient
w = direction(w)
if np.abs(f(X, w) - f(X, last_w)) < epsilon:
break
i_iter += 1
return w
def demean(X): # 需要对原始数据做demean处理 - 归零
return X - np.mean(X, axis=0)
X_pca = X.copy()
res = []
X_pca = demean(X_pca)
for i in range(n):
initial_w = np.random.random(X_pca.shape[1])
w = first_component(X_pca, initial_w)
res.append(w)
X_pca = X_pca - (X_pca.dot(w)).reshape(-1, 1) * w
return res
向量化运算 - 将原样本减去映射到w方向上的分量
X2 = np.empty(X.shape)
#for i in range(len(X)):
# X2[i] = X[i] - X[i].dot(w)*w #点乘得到向量的模,然后再乘上单位向量得到X[i]在w方向上的分量。
X2 = X - (X.dot(w)).reshape(-1, 1)*w #X.dot(w)得到一个向量,将向量转换为m*1维的矩阵,然后于w相乘,就是把模乘上单位向量,得到每个样本在这个单位向量上的分量。
测试代码:
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import sys
sys.path.append(r'C:\\N-20KEPC0Y7KFA-Data\\junhuawa\\Documents\\00-Play-with-ML-in-Python\\Jupyter')
import playML
from playML.pca import PCA
pca = PCA()
X = np.empty((100, 2))
X[:, 0] = np.random.uniform(0, 100, size=100)
X[:, 1] = 0.75*X[:, 0] + 3.0 + np.random.normal(0, 10, size=100)
w = PCA.first_n_components(2, X)
w
w[0].dot(w[1]) # 单位向量正交,点积为0
结果:
[array([0.7694744 , 0.63867765]), array([ 0.63870067, -0.7694553 ])]
2.991102889515762e-05